故事发生在Nemo与父亲团聚的六个月之后,主角换成了爱唠叨的Dory。记忆力短暂的她原本生活得很愉快,但一次事故让她重新记起了之前的家人和朋友,于是决定重新启程寻找原来的自己。Marlin和Nemo两父子一路陪伴她,一行人又展开了新一轮的海底冒险之旅。故事从上一部结尾的六个