太上武神诀里面的神秘黑衣人是吴云。在小说《太上武神诀》第2763章黑袍人的身份,《太上武神诀》黑袍人倒也没有反抗。而摘下面罩过后,露出了一张中年模样的脸。就是吴云。因此，太上武神诀里面的神秘黑衣人是吴云。