拳皇97剧情承接《拳皇95》和《拳皇96》事件源于大蛇一族意图复活他们的主、地球的意志之一“大蛇”，并令世界毁灭。本作中，一大型机构举办赛事，依旧草薙京与两名好友二阶堂红丸及大门五郎再度组队参赛，神乐千鹤加入正在缺人的女性格斗家队，八神庵则因为曾经因大蛇之力暴走