超级机器人大战COMPACT3背景

在宇宙世纪00XX年，地球似乎正面临历史以来最大危机。地面上，兜甲児驾驶的マジンガーZ与剑铁也的グレートマジンガー联手，终结了对ミケーネ帝国的作战。与百鬼一族的战斗也接近尾声，早乙女研究所的ゲッターロボ频繁出动。同时，南原コネクション和キャンベル星人即将面对最终的对决。

而宇宙方面，以残存的ジオン党和腐败的联邦组织产生出的ティターンズ为首，哈マーン统领的ネオ·ジオン军，以及其衍生的グレミー军，还有对宇宙战争担忧的トレーズ和他率领的OZ。这些组织保持沉默，蒂ターンズ集结残部最为显眼。地球似乎正陷入前所未有的危机。

然而，联邦组织的应对显得力不从心。由アーガマ队特别游击部队组成的联邦组织，虽有丰富战斗经验，却因剩余战斗由ブライト大佐和小队负责，而地面上アーガマ队与协力作战的スーバーロボット们的联系突然中断。这一状况导致后续半年内，各组织余党的清除进展缓慢，舆论对联邦组织的能力提出质疑，指责其未能解决兵力间持续摩擦的问题。

如今，新的战乱似乎不可避免地降临地球。危机四伏，各方势力的角力与冲突，正预示着一场更为激烈的冲突即将爆发。地球的命运将如何转折，新战乱将会带来怎样的变化与影响，这一切都将揭示出人类面对危机时的勇气与决心。