开了个5D电影院，文化局说要办理娱乐场所许可证

这个属于边缘管理范围，有地方管，有的地方不管。文化行政部门娱乐场所的游戏机，界定为具有电子交互功能，单独5D电影不属于游戏机。但你既然叫电影，那一般人肯定以为你需要办理放映经营许可证，而你放映的又不是院线电影，只是一些卡通片。所以只要你有版权就行了。否则可以按你盗版处罚你。

模拟游戏属于工商管理，有个执照就行了。如果处罚你，你可以向县政府文化行政部门或县政府申请行政复议。