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一文搞懂 PCR、qPCR、RT-PCR、RT-qPCR 及优缺点

一文搞懂 PCR、qPCR、RT-PCR、RT-qPCR 及优缺点-第1张-游戏信息-龙启网

PCR——实验室必备实验,从基因鉴定到信号通路验证,几乎每周都要做那么几次。

然而,各种PCR技术,包括PCR、qPCR、RT-PCR、RT-qPCR、Real-Time PCR和dPCR,长得实在是太像了,好多同学看得头晕眼花也没弄明白这几种PCR有什么区别。

今天,一篇文章,带你清清楚楚,明明白白一次性搞明白各种PCR之间的区别。

一、什么是PCR?

PCR是聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction)的简称,是美国科学家Kary B. Mullis 1985年发明的一种在体外快速扩增特定DNA片段的分子生物学技术。通过一系列精心设计的反应步骤,PCR可以在短时间内将微量的DNA片段扩增到足够数量,用于后续的研究和检测。

二、PCR技术的介绍

按照PCR技术的演进,习惯将PCR技术划分为三代:普通PCR技术;实时荧光定量PCR技术(qPCR);第三代数字PCR技术(dPCR)

(1)普通PCR技术

普通PCR即第一代PCR技术,以双链DNA为模板,以dNTP为底物进行扩增,特异性地扩增双链DNA的过程,然后采用琼脂糖凝胶电泳对产物进行定性分析。

(2)实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR, qPCR)

实时荧光定量PCR,即第二代PCR技术,是指在整个扩增的过程中,引入了荧光染料或者荧光基团,随着DNA数量的成倍增加,反应体系中的荧光信号也会增强。

(3)数字PCR

数字PCR(Digital PCR,Dig-PCR,dPCR)即第三代PCR技术,是对原始PCR的另一种改进,是一种能够实现核酸绝对定量的精准检测技术。

三、易混淆的PCR概念

很多人误以为RT-PCR是Real-time PCR的缩写,因此将二者混为一谈,但实际上是不一样的,国际上的约定俗成的是:RT-PCR特指反转录PCR,而Real-time PCR一般缩写为qPCR(quantitative real-time PCR)(见前面的介绍)。

四、总结

1.PCR,通常指的是普通PCR,以双链DNA为模板,以dNTP为底物,定性扩增双链DNA。

2.qPCR和Real-time PCR,指的是实时荧光定量PCR,以cDNA为模板,以dNTP 为底物,对扩增出的DNA进行定量分析。

3.RT-PCR,指的是逆转录PCR,以由mRNA逆转录成的cDNA为模板,以dNTP 为底物,进行DNA的扩增,属于PCR的变种,结果只能定性,不能定量。

4.RT-qPCR,指的是实时荧光定量逆转录PCR,是qPCR+RT-PCR的组合,将总RNA或mRNA逆转录成cDNA后再作为模板,以dNTP为底物,进行qPCR的定量分析。